81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1513 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1513  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 421 aa  791    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 441 aa  123  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05198  hypothetical protein  35.87 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  29.31 
 
 		 407 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 		 489 aa  90.9  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001317  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsJ Membrane protein export of O-antigen and teichoic acid  33.7 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 539 aa  83.2  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  27.54 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0561  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  27.32 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 495 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3971  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.137474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  22.25 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1933  polysaccharide biosynthesis protein  40.95 
 
 		 135 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.546859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  25.71 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  27.95 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  28.16 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.19 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  25.7 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.1 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1827  hypothetical protein  34.42 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.356009  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0643  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.120868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  26.23 
 
 		 458 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  25.7 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0639  polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 458 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 458 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  31.11 
 
 		 495 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 440 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.7 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 434 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  32.2 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  26.3 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4792  hypothetical protein  23.81 
 
 		 472 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0246434 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  30.03 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  23.54 
 
 		 489 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 504 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0637  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 500 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  23.01 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0259  polysaccharide biosynthesis protein  26.69 
 
 		 498 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1942  polysaccharide biosynthesis protein  29.09 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.634447  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1836  hypothetical protein  30.37 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  21.29 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3720  polysaccharide biosynthesis protein  27.3 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  28.79 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1009  polysaccharide biosynthesis protein  27.96 
 
 		 536 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>