More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1279 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1279  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0782  two component LuxR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 248 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.34 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1531  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  29.66 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2496  two component LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.61 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  27.56 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1239  two component LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0482404  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2393  response regulator receiver  24.84 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.820012  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1358  two component LuxR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.12 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 244 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.8 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.16 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.85 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.6 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 212 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.14 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.82 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2236  two-component LuxR family response regulator  31.78 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.36 
 
 		 253 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 209 aa  51.2  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.19 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0231149  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.41 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  26.87 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  28.79 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.35 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.62 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.43 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.82 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.22 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.3 
 
 		 238 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.6 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.63 
 
 		 221 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4619  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.68 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.167951  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2281  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.6 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.72 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.4 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  27.27 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.09 
 
 		 258 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.68 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  25.17 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 225 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 221 aa  48.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 215 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 226 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>