More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2236 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2236  two-component LuxR family response regulator  100 
 
 		 211 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4923  two component LuxR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  49.25 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.01 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.57 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8027  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4619  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.167951  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4137  response regulator receiver  44.06 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4505  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.06 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6781  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4197  two component LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 230 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2990  two component LuxR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1784  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000422915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  38.54 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3829  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.11 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  37.13 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  39.02 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  36.63 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  38.54 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.38 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  33.5 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  34.95 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  33.82 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7040  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 219 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.61 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  34.3 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  32.52 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.33 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  32.51 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  31.55 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  32.86 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  33.97 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  31.22 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 218 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  34.13 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  35.71 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>