More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6781 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6781  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.43 
 
 		 210 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.13 
 
 		 220 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.65 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  58.65 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.07 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4923  two component LuxR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 210 aa  221  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8027  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982767  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.94 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4137  response regulator receiver  49.01 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4505  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.01 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4619  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.02 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.167951  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2236  two-component LuxR family response regulator  42.79 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4197  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7040  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0653  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  39.71 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8023  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.634105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1784  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000422915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3829  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  31.9 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1539  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2990  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  30 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  30.48 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  33.33 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  30.14 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  36.06 
 
 		 218 aa  104  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  30 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  30 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  30 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  30 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  30.48 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  30 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  34.95 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  30.48 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  30.48 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  30.48 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  35.58 
 
 		 455 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  37.25 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  35.92 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>