More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2255 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2255  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0808718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26570  putative transcriptional regulator  90.09 
 
 		 212 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.604718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  31.88 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 212 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.07 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  31.4 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  30.33 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  30.33 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  30.33 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  30.92 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  31.4 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  30.33 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  32.16 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  30.81 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  31.4 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  32.16 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  31.66 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  34.47 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  31.16 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  32.34 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  35.75 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 241 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  30.69 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  29.85 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  30.69 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  31.9 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  35 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  32.18 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  32.18 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  31.68 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  29.5 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  29.5 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  29.5 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  31.16 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  27.96 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  29.47 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.91 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  29 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  27.54 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  29 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  30.2 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.04 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  29.5 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  29.41 
 
 		 230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>