106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1238 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1238  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
130 aa  267  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0468  TPR repeat-containing protein  36.72 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00208252 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
4079 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
202 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.63 
 
 
2401 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
543 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32 
 
 
668 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
1069 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1618  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
241 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 
1154 aa  47.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
329 aa  47.4  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.58 
 
 
1979 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 
519 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
388 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  26.61 
 
 
1073 aa  46.2  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
591 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
279 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 
602 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
329 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
395 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.72 
 
 
267 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.36 
 
 
863 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
927 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
344 aa  43.9  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.22 
 
 
818 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0032  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1445 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
265 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
1276 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 
576 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  38.18 
 
 
1240 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  27 
 
 
632 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  25.51 
 
 
648 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
587 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 
890 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  32.47 
 
 
379 aa  43.5  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
988 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4511  hypothetical protein  29.21 
 
 
727 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 
344 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 
1067 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
402 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
884 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  32.56 
 
 
745 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
562 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  38.18 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
639 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  28.71 
 
 
417 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.69 
 
 
1138 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 
758 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 
1694 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
213 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42733  predicted protein  27.45 
 
 
604 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.738056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
732 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
187 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 
217 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
393 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
219 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3179  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
187 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
1252 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 
635 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 
329 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 
747 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
568 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
750 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  40 
 
 
284 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
917 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.59 
 
 
397 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2035  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
194 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
243 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
935 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
207 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0640  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
409 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
436 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
352 aa  40.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 
265 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.67 
 
 
784 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  31.63 
 
 
936 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
421 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
357 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  26.09 
 
 
219 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
520 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  26.45 
 
 
369 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 
273 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
319 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3923  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.52162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
214 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>