More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1046 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1046  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
530 aa  1069    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 
817 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 
817 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
1480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.91 
 
 
1468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.37 
 
 
567 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
667 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
670 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0539  sensory box, GGDEF family protein  43.66 
 
 
567 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0539  sensory box, GGDEF family protein  43.66 
 
 
567 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0683  sensory box/GGDEF family protein  43.66 
 
 
567 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00619208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0696  sensory box/GGDEF family protein  43.66 
 
 
568 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.612215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0757  sensory box/GGDEF family protein  42.96 
 
 
567 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4673  sensory box/GGDEF family protein  41.55 
 
 
567 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.6834899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0595  sensory box/GGDEF family protein  42.96 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0628  sensory box/GGDEF family protein  42.96 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
618 aa  121  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0664  sensory box/GGDEF family protein  40.85 
 
 
567 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  38.62 
 
 
967 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  38.62 
 
 
967 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.78 
 
 
1229 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.758672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1033 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
1207 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
916 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
591 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  45.13 
 
 
768 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.18 
 
 
932 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
1568 aa  108  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  40.27 
 
 
525 aa  106  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  39.29 
 
 
934 aa  106  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1083  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.87 
 
 
812 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
1245 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1560 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
1202 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  40.18 
 
 
931 aa  104  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
791 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1041 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
894 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.530834 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
404 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
737 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1889  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 
562 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.969395  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2258  sensory box protein  32.73 
 
 
562 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202787  normal  0.0243284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.73 
 
 
562 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629722  normal  0.285223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1066 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
1177 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2926  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.86 
 
 
461 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000284142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
773 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.021882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4925  sensory box sensor histidine kinase  41.12 
 
 
614 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.25 
 
 
2035 aa  100  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.51 
 
 
568 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179735  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1114  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.24 
 
 
722 aa  99.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.307073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1921  PAS sensor protein  41.59 
 
 
407 aa  99.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0254  PAS sensor protein  33.33 
 
 
836 aa  99  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
773 aa  97.8  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4387  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.14 
 
 
718 aa  97.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1984  PAS sensor protein  37.7 
 
 
506 aa  97.1  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.117644  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
901 aa  97.1  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0281  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
526 aa  96.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.630164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2631  hypothetical protein  23.23 
 
 
782 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2771  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.39 
 
 
860 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  43.7 
 
 
1274 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
673 aa  95.1  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2558  signal transduction protein  41.23 
 
 
1061 aa  94.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 
1632 aa  94.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.55 
 
 
1050 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
954 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
926 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1928  two component LuxR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
487 aa  92.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.49 
 
 
425 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0900  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
409 aa  92.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1079 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.79 
 
 
1017 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1070 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
1118 aa  92  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2193  diguanylate cyclase  27.13 
 
 
1196 aa  91.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.941342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.95 
 
 
989 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1941  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.51 
 
 
861 aa  90.9  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  39.81 
 
 
754 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.57 
 
 
1027 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0980  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 
1171 aa  90.5  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1313 aa  90.5  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1222 aa  90.1  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
681 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2055  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.21 
 
 
1034 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1101 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
1064 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.82 
 
 
1061 aa  89  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0511  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 
495 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  39.81 
 
 
637 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0029  hypothetical protein  39.5 
 
 
976 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0376  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
412 aa  88.6  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 
649 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.15 
 
 
764 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.210593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0030  hypothetical protein  39.5 
 
 
976 aa  87.8  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0601  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.82 
 
 
489 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
650 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
769 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>