185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0978 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0978  response regulator receiver protein  100 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1529  cobalamin B12-binding domain protein  31.67 
 
 		 372 aa  90.1  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  30 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35010  predicted cobalamin binding protein  26.09 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.77206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2639  cobalamin B12-binding  24.83 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1467  cobalamin B12-binding  22.7 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0673  cobalamin B12-binding domain protein  26.39 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.846284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  23.29 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0291  cobalamin B12-binding domain protein  23.56 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  22.22 
 
 		 1215 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3086  hypothetical protein  29.31 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3324  cobalamin B12-binding protein  19.25 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0655  cobalamin B12-binding domain protein  23.35 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3386  cobalamin B12-binding domain-containing protein  19.25 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0329482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3335  cobalamin B12-binding domain-containing protein  19.25 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.79 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0967  cobalamin B12-binding domain protein  25.58 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0675  cobalamin B12-binding domain protein  26.2 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000394435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  22.73 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2584  cobalamin B12-binding domain protein  23.02 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0156694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  25.44 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  24.7 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  25.56 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  23.84 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4920  cobalamin B12-binding domain protein  22.31 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230842  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3258  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.48 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  19.89 
 
 		 768 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  19.89 
 
 		 768 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1030  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.21 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4482  cobalamin binding protein-like protein  23.02 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000437324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  23.68 
 
 		 1226 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  22.52 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  22.07 
 
 		 1158 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5806  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.07 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 335 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.43 
 
 		 1132 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  23.66 
 
 		 1226 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.11 
 
 		 1226 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1267  methionine synthase  25.17 
 
 		 832 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0061  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  22.41 
 
 		 1226 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  27.97 
 
 		 1178 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  22.6 
 
 		 1223 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  30.48 
 
 		 1132 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3503  methionine synthase  25.58 
 
 		 1212 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929135  normal  0.479801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  22.6 
 
 		 1154 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0956  cobalamin B12-binding protein  24.18 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  21.55 
 
 		 1158 aa  52.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1691  cobalamin B12-binding domain protein  23.33 
 
 		 339 aa  52.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1133 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1133 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  28.57 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  24.84 
 
 		 1176 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  20.31 
 
 		 793 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  20.44 
 
 		 1168 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.52 
 
 		 1132 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  25.9 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  17.94 
 
 		 1150 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  21.28 
 
 		 774 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  23.73 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2104  cobalamin B12-binding domain protein  19.7 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  27.62 
 
 		 1132 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  17.56 
 
 		 1150 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  17.56 
 
 		 1150 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1531  methionine synthase (B12-dependent)  22.28 
 
 		 1182 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0024  methyltransferase cognate corrinoid protein  23.67 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0108  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.48 
 
 		 356 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  20.16 
 
 		 1227 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  22.1 
 
 		 1195 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  20.34 
 
 		 1157 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  23.58 
 
 		 1136 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  23.21 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  20.27 
 
 		 780 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  26.77 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  21.12 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3604  dimethylamine corrinoid protein  22.16 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.220504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0283  regulatory protein, PpaA  25.17 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2751  cobalamin B12-binding protein  21.09 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1365  dimethylamine corrinoid protein  22.28 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000308359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5159  twin-arginine translocation pathway signal  22.38 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5248  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.38 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  26.77 
 
 		 1191 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1926  regulatory protein, PpaA  25.17 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.120829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5540  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.38 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.83435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  22.22 
 
 		 1171 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  19.27 
 
 		 1193 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  25 
 
 		 1180 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  20.53 
 
 		 1178 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  23.33 
 
 		 1187 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>