More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0729 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  82.62 
 
 		 497 aa  822    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  64.98 
 
 		 497 aa  669    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  62.65 
 
 		 507 aa  648    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 514 aa  1048    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  60.81 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  43.79 
 
 		 642 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  43.02 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  42.08 
 
 		 497 aa  369  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  37.11 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  38.04 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  38.01 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  37.56 
 
 		 482 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  37.62 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  39.77 
 
 		 476 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  38.18 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  40 
 
 		 454 aa  279  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  38.87 
 
 		 481 aa  279  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  38.12 
 
 		 451 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  33.59 
 
 		 413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  31.47 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  31.3 
 
 		 421 aa  203  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  30.96 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  31.55 
 
 		 418 aa  196  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  32.24 
 
 		 422 aa  195  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  30.84 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  32.11 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  27.71 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25.2 
 
 		 892 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  24.88 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  38.35 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  33.64 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  34.3 
 
 		 289 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  32.88 
 
 		 324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  31.14 
 
 		 348 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  32.85 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  32.88 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  32.42 
 
 		 319 aa  108  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  33.17 
 
 		 326 aa  108  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  30.26 
 
 		 1092 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  32.85 
 
 		 349 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  33.01 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  34.31 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  33.17 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  31.73 
 
 		 329 aa  104  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  32.69 
 
 		 328 aa  104  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  31.22 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  30.77 
 
 		 315 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  30.77 
 
 		 315 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28.8 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  31.07 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  32.54 
 
 		 334 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  24.91 
 
 		 1001 aa  98.6  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  30.77 
 
 		 325 aa  99  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  31.28 
 
 		 315 aa  99.4  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  31.11 
 
 		 332 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.73 
 
 		 321 aa  96.7  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  32.57 
 
 		 330 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  31.1 
 
 		 334 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  31.19 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  30.73 
 
 		 322 aa  92.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  25.43 
 
 		 764 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  29.47 
 
 		 373 aa  91.7  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  32.24 
 
 		 327 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  27.35 
 
 		 942 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  27.97 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  29.41 
 
 		 322 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  30.24 
 
 		 326 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  29.81 
 
 		 322 aa  87.8  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  30 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  28.37 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  28.97 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  29.8 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  27.44 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  25.96 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  26.99 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  30.88 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  28.18 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  31 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  28.23 
 
 		 316 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.52 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  27.97 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  24.73 
 
 		 725 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  35.45 
 
 		 940 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  26.61 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  21.54 
 
 		 571 aa  67  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.93 
 
 		 632 aa  67  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.82 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  24.75 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  22.75 
 
 		 993 aa  64.7  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  28.91 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0211  recombination factor protein RarA  26.46 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  26.91 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.69 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  26.83 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  26.7 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  24.57 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0186  recombination factor protein RarA  24.31 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0991  recombination factor protein RarA  24.05 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  26.85 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>