More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4437 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  100 
 
 		 349 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  57.98 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  57.59 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  56.35 
 
 		 340 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  56.66 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  48.45 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  48.3 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  47.56 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  47.06 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  46.75 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  44.79 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  42.81 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.74 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.59 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  41.18 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  41.51 
 
 		 344 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.81 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  38.75 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  38.44 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.8 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.54 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  41.2 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.85 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.36 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.81 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  37.7 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  33.44 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  33.11 
 
 		 487 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  34.6 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  34.08 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 477 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  37.41 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3812  type II secretion system protein E  33.84 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.38086 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 472 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.58 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  33.75 
 
 		 589 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.99 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.46 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  34.77 
 
 		 455 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  33.02 
 
 		 572 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  34.77 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  34.77 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  33.99 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  34.23 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  35.55 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3983  type II secretion system protein E  32.52 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  38.95 
 
 		 372 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  33.67 
 
 		 594 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  32.67 
 
 		 639 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  33 
 
 		 449 aa  173  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 458 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.33 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 455 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3648  type II secretion system protein E  32.82 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0223544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.77 
 
 		 455 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  32.08 
 
 		 569 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  33.87 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  34.9 
 
 		 466 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  34.44 
 
 		 455 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 460 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.36 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 467 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 454 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  33.99 
 
 		 563 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  34.11 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  34.21 
 
 		 521 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.06 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.2 
 
 		 521 aa  169  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 459 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  35.22 
 
 		 515 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.24 
 
 		 463 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  34.49 
 
 		 523 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  35.22 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  35.22 
 
 		 520 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  35.22 
 
 		 523 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  39.06 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 624 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  31.79 
 
 		 463 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  35.22 
 
 		 520 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  35.22 
 
 		 520 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  33.01 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.68 
 
 		 456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7220  type II secretion system protein E  36.79 
 
 		 632 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177916  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  38.3 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  32.45 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  39.02 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  39.35 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  39.35 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>