More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1912 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  70.54 
 
 		 242 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  69.46 
 
 		 243 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  69.29 
 
 		 242 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  67.78 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  68.2 
 
 		 243 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  63.56 
 
 		 226 aa  291  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  61.6 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  49.1 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  40.87 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  42.19 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  42.19 
 
 		 247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  43.03 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  39.91 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.83 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  39.13 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  38.7 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  38.63 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  37.28 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  38.29 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  38.26 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  38.74 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  38.24 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  34.07 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.08 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.75 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  36.82 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  39.3 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  37.36 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  40.24 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.75 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  39.07 
 
 		 147 aa  99.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  35.4 
 
 		 339 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  34.76 
 
 		 348 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  33.56 
 
 		 149 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 152 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.72 
 
 		 155 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  32.68 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.69 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  37.23 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  33.33 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.78 
 
 		 427 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  33.51 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  35.17 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  31.67 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32.87 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  34.25 
 
 		 153 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  32.41 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.17 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  31.94 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  27.8 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  29.12 
 
 		 428 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  33.95 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 149 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  28.83 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  29.06 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  34.72 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  30 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  30.63 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  33.53 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  30.34 
 
 		 153 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.02 
 
 		 227 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  27.21 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  32.64 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.17 
 
 		 149 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  32.86 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  29.58 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  29.86 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  31.79 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  27.16 
 
 		 164 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  34.29 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  31.33 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  35.46 
 
 		 904 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.29 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2651  putative signal transduction protein with CBS domains  28.92 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  30.45 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  36.03 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.21 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.03 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  34 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  31.4 
 
 		 907 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>