123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3254 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  65.28 
 
 		 224 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  46.86 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  45.63 
 
 		 210 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  43.48 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  42.51 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  40.85 
 
 		 211 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.5 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  36.63 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.81 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  28.71 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.86 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  25.25 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.33 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  25.62 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  28.89 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.96 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.3 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.95 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  24.64 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  27.48 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.11 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  23.59 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  28.19 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  23.59 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  25.12 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  23.7 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.03 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  23.19 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  24.08 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  25.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 		 272 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.94 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  25.64 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  24.61 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  22.75 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  23.28 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  24.48 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  24.04 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  26.02 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0774  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  20.74 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  22.68 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  23.66 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.04 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  25.63 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  22.51 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.44 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 		 238 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  23.44 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  21.33 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.85 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  24.1 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  21.99 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  24.6 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.98 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  20.89 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.39 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.38 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.33 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3109  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.33 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  hitchhiker  0.0000000066248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  20.89 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  20.59 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  21.69 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  25.39 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>