More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3073 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
456 aa  905    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  50.14 
 
 
685 aa  351  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  44.48 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  41.42 
 
 
456 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  40.23 
 
 
372 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  40.45 
 
 
536 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 
342 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  39.3 
 
 
401 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.43 
 
 
368 aa  190  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 
387 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 
397 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  33.07 
 
 
397 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  39.94 
 
 
368 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  34.66 
 
 
493 aa  167  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 
395 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  32.32 
 
 
417 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  32.29 
 
 
390 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 
413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  34.86 
 
 
395 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  34.89 
 
 
485 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  32.75 
 
 
340 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  36.81 
 
 
356 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  31.28 
 
 
407 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  30.91 
 
 
409 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 
401 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  34.06 
 
 
588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 
370 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  31.6 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  31.49 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  31.49 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  31.49 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  31.49 
 
 
340 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 
415 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  37.55 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  32.76 
 
 
357 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  31.85 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  32.13 
 
 
340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  30.41 
 
 
356 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.49 
 
 
356 aa  133  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.59 
 
 
356 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  30.73 
 
 
388 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.86 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 
451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 
434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.4 
 
 
351 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  30.83 
 
 
587 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.4 
 
 
356 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 
376 aa  129  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  30.28 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 
403 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  33.65 
 
 
403 aa  127  5e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  28.92 
 
 
347 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 
362 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.61 
 
 
351 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.88 
 
 
345 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
331 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 
352 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.13 
 
 
391 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  29.33 
 
 
438 aa  124  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.05 
 
 
336 aa  123  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.58 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.95 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.08 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  29.05 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.17 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.77 
 
 
344 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  30.86 
 
 
341 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 
335 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.81 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 
362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  29.46 
 
 
418 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 
339 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>