More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0876 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  100 
 
 		 543 aa  1102    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  69.07 
 
 		 539 aa  748    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  47.42 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  47.09 
 
 		 547 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  46.07 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  46.44 
 
 		 547 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  45.49 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  46.62 
 
 		 547 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.55 
 
 		 547 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.71 
 
 		 549 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.14 
 
 		 550 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.59 
 
 		 552 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 		 541 aa  401  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  41.46 
 
 		 534 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.42 
 
 		 1004 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 		 555 aa  326  7e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  35.89 
 
 		 546 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  35.7 
 
 		 546 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 548 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  34.57 
 
 		 548 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  34.2 
 
 		 546 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 548 aa  302  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  34.2 
 
 		 566 aa  299  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  34.2 
 
 		 566 aa  299  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 500 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 552 aa  297  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 540 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 517 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 		 543 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 498 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 503 aa  280  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 512 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.65 
 
 		 518 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  30.96 
 
 		 550 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 630 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 526 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 524 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 527 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 524 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 		 549 aa  237  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.87 
 
 		 538 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.26 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 552 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.33 
 
 		 538 aa  230  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.65 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  27.81 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.68 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.65 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 1043 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 		 576 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12409  bifunctional enzyme mbtA: salicyl-AMP ligase + salicyl-S-arcp synthetase  33.95 
 
 		 565 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 552 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 550 aa  226  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 523 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 523 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.46 
 
 		 538 aa  226  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.7 
 
 		 538 aa  225  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  33.27 
 
 		 994 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.7 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.05 
 
 		 574 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.7 
 
 		 538 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 549 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 571 aa  224  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  30.22 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.03 
 
 		 526 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 534 aa  223  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.15 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  32.04 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 		 576 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  30.5 
 
 		 573 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 		 538 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  30.84 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  31.11 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 578 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.33 
 
 		 538 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.33 
 
 		 538 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 532 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 554 aa  220  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  30.66 
 
 		 576 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>