More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0192 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  38.3 
 
 		 1024 aa  739    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1044 aa  662    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.97 
 
 		 1052 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  35.83 
 
 		 1038 aa  699    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  35.77 
 
 		 1039 aa  664    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1069 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1048 aa  704    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1068 aa  680    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  100 
 
 		 1025 aa  2075    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.25 
 
 		 1032 aa  721    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  35.8 
 
 		 1034 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  36.03 
 
 		 1042 aa  667    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  36.63 
 
 		 1045 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  36.25 
 
 		 1038 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1041 aa  676    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1057 aa  632  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 		 1033 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1067 aa  538  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1162  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1189 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1092 aa  459  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1043 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1267 aa  414  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  27.96 
 
 		 1134 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1143 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2196  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 		 1335 aa  344  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  26.43 
 
 		 1165 aa  344  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.47 
 
 		 1050 aa  331  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1011 aa  317  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1044 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1044 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  24.44 
 
 		 1031 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25 
 
 		 1024 aa  299  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1006 aa  299  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 1496 aa  295  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1031 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.07 
 
 		 1030 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1031 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  24.15 
 
 		 1031 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1031 aa  291  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1033 aa  290  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1065 aa  289  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 		 1034 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.39 
 
 		 1034 aa  288  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  24.25 
 
 		 1020 aa  287  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  24.71 
 
 		 1031 aa  287  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  24.07 
 
 		 1031 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1032 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  23.88 
 
 		 1031 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  23.88 
 
 		 1031 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1036 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  23.21 
 
 		 1034 aa  285  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  23.57 
 
 		 1071 aa  284  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  25 
 
 		 1020 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  24.33 
 
 		 1042 aa  282  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  23.33 
 
 		 1026 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1038 aa  281  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.1 
 
 		 1049 aa  281  7e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  23.57 
 
 		 1043 aa  280  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1041 aa  280  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.49 
 
 		 1031 aa  278  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.3 
 
 		 1470 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  23.78 
 
 		 1034 aa  278  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1051 aa  277  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  23.41 
 
 		 1039 aa  274  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  24.14 
 
 		 1014 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  23.29 
 
 		 1045 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  22.73 
 
 		 1028 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  23.78 
 
 		 1053 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1043 aa  272  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1028 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  24.27 
 
 		 1028 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  23.5 
 
 		 1041 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  23.44 
 
 		 1038 aa  270  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  23.34 
 
 		 1029 aa  269  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.83 
 
 		 1058 aa  268  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  23.08 
 
 		 1038 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  23.97 
 
 		 1036 aa  268  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  23.44 
 
 		 1034 aa  267  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2951  acriflavin resistance protein  24.88 
 
 		 1038 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  23.54 
 
 		 1037 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  23.49 
 
 		 1039 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  24.09 
 
 		 1046 aa  265  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1638  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1047 aa  265  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2236  acriflavin resistance protein  24.16 
 
 		 1047 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1023 aa  263  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1035 aa  262  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  22.62 
 
 		 1044 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1024  acriflavin resistance protein  25.09 
 
 		 1037 aa  263  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197282 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1711  acriflavin resistance protein  23.97 
 
 		 1047 aa  262  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  22.22 
 
 		 1070 aa  260  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  23.04 
 
 		 1069 aa  260  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  24.05 
 
 		 1034 aa  259  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  23.44 
 
 		 1022 aa  259  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  22.74 
 
 		 1037 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  24.49 
 
 		 1110 aa  258  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  22.86 
 
 		 1022 aa  259  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  23.88 
 
 		 1046 aa  258  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  23.7 
 
 		 1029 aa  258  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  24.11 
 
 		 1041 aa  258  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  23.49 
 
 		 1073 aa  257  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>