282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_01891 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  64.38 
 
 		 490 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  72.69 
 
 		 484 aa  744    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  64.38 
 
 		 490 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  64.35 
 
 		 479 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  96.5 
 
 		 486 aa  975    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  64.77 
 
 		 479 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  76.64 
 
 		 488 aa  811    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  75.2 
 
 		 488 aa  801    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  71.6 
 
 		 499 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  68.99 
 
 		 481 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  76.73 
 
 		 490 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  100 
 
 		 486 aa  1007    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  62.45 
 
 		 482 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  63.37 
 
 		 483 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  63.77 
 
 		 489 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  77.62 
 
 		 478 aa  798    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  72.07 
 
 		 484 aa  742    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  72.69 
 
 		 484 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  51.13 
 
 		 591 aa  515  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  35.19 
 
 		 455 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  35.26 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  34.72 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  34.93 
 
 		 453 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  33.81 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  33.4 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  33.2 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  33.69 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  35.55 
 
 		 479 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  34.51 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  34.3 
 
 		 475 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  33.74 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  33 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  32.93 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  33.68 
 
 		 471 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  33.06 
 
 		 472 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 465 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.98 
 
 		 474 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  33.94 
 
 		 479 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  32.72 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  32.92 
 
 		 473 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  33.54 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  32.32 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32.85 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  33.47 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  31.98 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  33 
 
 		 599 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  32.22 
 
 		 464 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  32.28 
 
 		 461 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  32.02 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  31.57 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  30.75 
 
 		 624 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  32.33 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  30.28 
 
 		 461 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  30.92 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  31.49 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.51 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.1 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  25 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.25 
 
 		 439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  22.98 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  27.16 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  23.05 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  23.05 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  23.05 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.31 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.11 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  22.24 
 
 		 506 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  22.24 
 
 		 506 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  21.75 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  21.84 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  23.7 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  20.94 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  26.97 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.84 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.91 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  26.59 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.23 
 
 		 811 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  24.91 
 
 		 989 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.81 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  25.1 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.97 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.33 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  27.27 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  22.18 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  30.41 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  26.8 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  22.15 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.19 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  24.06 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  23.05 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  40 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  25.87 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  20.69 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  24.59 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  40.79 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  39.71 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.74 
 
 		 647 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  23.51 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>