More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1163 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  59.6 
 
 		 261 aa  291  9e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  56.25 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  56.64 
 
 		 267 aa  284  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  57.47 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  57.96 
 
 		 268 aa  278  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  57.03 
 
 		 266 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  58.96 
 
 		 271 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  57.96 
 
 		 267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  58.85 
 
 		 267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.35 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  55.28 
 
 		 274 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  58.85 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  53.57 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  59.17 
 
 		 267 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.38 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  55.28 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  56.79 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  51.44 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  55.92 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  55.51 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  56.85 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  53.17 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  52.4 
 
 		 282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 		 284 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  52.48 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.37 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  48.09 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  51.03 
 
 		 304 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  50.62 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  49.41 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.58 
 
 		 278 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.73 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.08 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  47.58 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.77 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  48.05 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.48 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  49.55 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.32 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  47.84 
 
 		 272 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.78 
 
 		 289 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.37 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  47.98 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.78 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  48.88 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.78 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  47.06 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.25 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.77 
 
 		 276 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.46 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.26 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.73 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.56 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  48.57 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  47.37 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.78 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  45.16 
 
 		 255 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.92 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.39 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  51.01 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.74 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.74 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.72 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  45.31 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.75 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  51.4 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  47.46 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  48.72 
 
 		 261 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  47.19 
 
 		 265 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.6 
 
 		 292 aa  194  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.3 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.17 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  47.7 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.71 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  44.53 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.57 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.88 
 
 		 289 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  46.75 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.73 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  43.53 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.27 
 
 		 284 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.44 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>