171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1472 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  100 
 
 		 251 aa  508  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  70.97 
 
 		 268 aa  370  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  35.34 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.4 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  33.6 
 
 		 305 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  35.02 
 
 		 313 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  34.06 
 
 		 329 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 599 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  33.61 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  32.24 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  33.2 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  32.52 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  34.52 
 
 		 304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  34.22 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  32.65 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  31.76 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  32.79 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  34.63 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  31.71 
 
 		 297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  32.31 
 
 		 326 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.4 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  30.89 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  31.52 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  31.97 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  30.54 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  31.01 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  30.4 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  29.6 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  30.86 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  31.43 
 
 		 332 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  30.74 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  31.97 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  30.49 
 
 		 293 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  31.15 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.05 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  34 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  32.77 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  30.59 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.65 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  29.02 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  31.6 
 
 		 325 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  30.65 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.34 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  29.1 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  31.15 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.74 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  29.76 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  31.33 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  30.24 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  30.65 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  30.65 
 
 		 295 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  32.06 
 
 		 331 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  28.02 
 
 		 325 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  31.58 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  29.51 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.98 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  30.65 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  29.57 
 
 		 321 aa  89.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  29.12 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  30.35 
 
 		 320 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  30.21 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.04 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  29.18 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  28.75 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.33 
 
 		 590 aa  82.8  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  29.46 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  27.27 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.22 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.56 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.44 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28 
 
 		 453 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.07 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.79 
 
 		 448 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.48 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.63 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.06 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1153  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.74 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  27.27 
 
 		 505 aa  52.4  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.67 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  26.67 
 
 		 461 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.29 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.44 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  23.56 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.19 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.62 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4266  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.11 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0808  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.11 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.85 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.44 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.44 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2257  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.34 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  26.16 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.25 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  24.67 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.45 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.68 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.85 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>