More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1734 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1734  tRNA modification GTPase TrmE  100 
 
 		 437 aa  867    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  76.2 
 
 		 436 aa  652    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0478  tRNA modification GTPase TrmE  57.05 
 
 		 439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3441  tRNA modification GTPase TrmE  44.47 
 
 		 454 aa  339  7e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  39.35 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  37.99 
 
 		 460 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  37.77 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2930  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 458 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.137366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  37.17 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1940  tRNA modification GTPase TrmE  38.26 
 
 		 462 aa  315  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000114309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  41.34 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  37.69 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  42.26 
 
 		 448 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4148  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2992  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 458 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2669  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  36.18 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  38.19 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0375  tRNA modification GTPase TrmE  37.75 
 
 		 459 aa  302  6.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  38.19 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3161  tRNA modification GTPase TrmE  41.96 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.258894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3429  tRNA modification GTPase TrmE  37.47 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000224644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0089  tRNA modification GTPase TrmE  38.75 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3641  tRNA modification GTPase TrmE  40.04 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0977  tRNA modification GTPase TrmE  36.89 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000239803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2889  tRNA modification GTPase TrmE  40.48 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4024  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 458 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4133  tRNA modification GTPase TrmE  37.12 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0876  tRNA modification GTPase TrmE  37.83 
 
 		 458 aa  293  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3486  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2945  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0139032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  39.74 
 
 		 460 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  39.96 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  37.14 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  36.48 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  36.4 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2137  tRNA modification GTPase TrmE  40.96 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.075642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  38.02 
 
 		 461 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  33.99 
 
 		 458 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  39.22 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5611  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.292564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5324  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0322996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2572  GTPase  38.31 
 
 		 459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.329632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1895  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.51566e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0097  tRNA modification GTPase TrmE  34.36 
 
 		 455 aa  289  7e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0992  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00719085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  38.11 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.26 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.7 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  38.78 
 
 		 462 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  36.31 
 
 		 469 aa  286  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2195  tRNA modification GTPase TrmE  38.51 
 
 		 475 aa  285  9e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  38.72 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  38.9 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0645  tRNA modification GTPase TrmE  39.81 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5742  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2030  tRNA modification GTPase TrmE  36.67 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.312338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  38.16 
 
 		 458 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  36.9 
 
 		 467 aa  283  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  37 
 
 		 455 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  33.7 
 
 		 452 aa  283  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  39.91 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1733  tRNA modification GTPase TrmE  32.89 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000059641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  37.61 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73400  tRNA modification GTPase TrmE  38.83 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000503354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 461 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0248  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 		 473 aa  279  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5611  tRNA modification GTPase TrmE  39.06 
 
 		 456 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  38.7 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52440  tRNA modification GTPase TrmE  39.48 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5133  tRNA modification GTPase TrmE  39.32 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4619  tRNA modification GTPase TrmE  38.86 
 
 		 455 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0643  tRNA modification GTPase TrmE  41.76 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.461676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34 
 
 		 441 aa  276  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0070  tRNA modification GTPase TrmE  38.07 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.868206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  35.81 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4013  tRNA modification GTPase TrmE  37.64 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.205295  normal  0.289015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3774  tRNA modification GTPase TrmE  36.07 
 
 		 466 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0161001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3622  tRNA modification GTPase TrmE  38.99 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  37.01 
 
 		 473 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3612  tRNA modification GTPase TrmE  38.38 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  35.5 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2233  tRNA modification GTPase TrmE  40.65 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  36.42 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  35.59 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6368  tRNA modification GTPase TrmE  39.69 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  35.37 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  36.82 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>