167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0130 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0130  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  63.4 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.25 
 
 		 202 aa  227  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.26 
 
 		 201 aa  221  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5960  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.9 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0718627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5209  TPR repeat-containing protein  63.64 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.221692  normal  0.106965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3988  tetratricopeptide TPR_2  40.78 
 
 		 219 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1419  TPR repeat-containing protein  42.04 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1399  tetratricopeptide TPR_2  38.14 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.972416  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.49 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1787  TPR repeat-containing protein  41.42 
 
 		 290 aa  121  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0984  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2028  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 205 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287446  normal  0.576518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1215  tetratricopeptide TPR_2  37.3 
 
 		 224 aa  117  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  40.12 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0086  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 307 aa  115  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1561  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.707304  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_004310  BR1747  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1084  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1687  TPR domain-containing protein  38.41 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2421  hypothetical protein  38.95 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1166  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 230 aa  104  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2063  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 		 243 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3257  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841733  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3277  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3576  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316735  normal  0.110411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0204  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0782  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.18 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0782775  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3687  hypothetical protein  31.48 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1829  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  37.04 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3312  TPR protein  33.53 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995394  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2533  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4966  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2056  tetratricopeptide TPR_2  32.17 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134429  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4894  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 628 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0175  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.723088 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1025  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.75 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3560 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 662 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  37.66 
 
 		 577 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 574 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1276 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8734  predicted protein  27.1 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.662786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1201  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.28 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.564024  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1096 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1693  tetratricopeptide TPR_2  31.67 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.521297  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.29 
 
 		 1022 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.67 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.57 
 
 		 730 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 4079 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  30.67 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  35.71 
 
 		 739 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 301 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 291 aa  48.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  28.72 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 371 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 740 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1827 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 361 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.68 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  35.48 
 
 		 1013 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 927 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 542 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 707 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  32.61 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  24.26 
 
 		 539 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  33.68 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1192 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.46 
 
 		 1056 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 428 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 883 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 649 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 784 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 450 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.05 
 
 		 560 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 4489 aa  45.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 3035 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.91 
 
 		 582 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0240215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 767 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3390  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 515 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1138 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>