183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1851 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1851  hydrogenase expression/formation protein HypD  100 
 
 		 341 aa  698    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1301  hydrogenase expression/formation protein HypD  78.82 
 
 		 342 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00908036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1140  hydrogenase expression/formation protein HypD  80.06 
 
 		 343 aa  568  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.703193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0502  hydrogenase expression/formation protein HypD  74.25 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.539415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1211  hypothetical protein  73.31 
 
 		 342 aa  531  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0842622  normal  0.019254 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1300  hydrogenase expression/formation protein HypD  51 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1384  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.28 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0664  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.14 
 
 		 360 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.876895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1292  hydrogenase expression/formation protein HypD  49.28 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0896  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.5 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2332  hydrogenase formation HypD protein  48.68 
 
 		 373 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0464  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.51 
 
 		 361 aa  316  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2812  HypD' protein  47.9 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1849  hydrogenase expression/formation protein  44.35 
 
 		 372 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4099  hydrogenase expression/formation protein HypD  47.37 
 
 		 376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4014  hydrogenase expression/formation protein HypD  50.76 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.372388  normal  0.161681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3063  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.69 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1960  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.39 
 
 		 381 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2448  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.66 
 
 		 379 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0276504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0139  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.51 
 
 		 360 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0327705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3966  hydrogenase formation HypD protein  44.82 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2007  hydrogenase formation HypD protein  44.8 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1282  hydrogenase expression/formation protein HypD  48.54 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.467018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2276  hydrogenase formation HypD protein  43.55 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0682  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.21 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3634  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.48 
 
 		 367 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0142  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.32 
 
 		 393 aa  294  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7252  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.64 
 
 		 376 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.519076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0507  hydrogenase formation HypD protein  45.13 
 
 		 378 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.291236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0502  hydrogenase formation HypD protein  45.13 
 
 		 378 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2657  hydrogenase formation HypD protein  43.71 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2049  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.29 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2595  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.61 
 
 		 369 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0474  hydrogenase formation HypD protein  45.13 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0516  hydrogenase formation HypD protein  44.57 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.646175 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0724  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.8 
 
 		 363 aa  292  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0974  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.96 
 
 		 371 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.980322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4509  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.69 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3401  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.98 
 
 		 362 aa  292  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4604  hydrogenase formation HypD protein  42.86 
 
 		 383 aa  291  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1076  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.51 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.490079  normal  0.158086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0364  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.38 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1539  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.44 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000400183  normal  0.116221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0795  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.48 
 
 		 377 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.912366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0728  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.05 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1455  hydrogenase formation HypD protein  43.14 
 
 		 362 aa  287  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0472  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.39 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.623296 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0654  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.76 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0801  hydrogenase formation HypD protein  44.41 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3878  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.22 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0089  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.75 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0389  hydrogenase formation HypD protein  41.43 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.483899  hitchhiker  0.0000000115047 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1044  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.48 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.722002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3796  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.67 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44763  normal  0.895026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3236  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.07 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2177  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.6 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.380266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1705  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.29 
 
 		 371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.340264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0117  hydrogenase formation HypD protein  43.54 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2015  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.87 
 
 		 378 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2888  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.15 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270319  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00520  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.67 
 
 		 359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3290  hydrogenase expression/formation protein HypD  46.15 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1762  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.43 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01200  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.83 
 
 		 370 aa  282  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2537  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.14 
 
 		 368 aa  282  5.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1177  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.45 
 
 		 380 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2134  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.12 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2180  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.12 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.483426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2121  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.12 
 
 		 366 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164899  normal  0.0352453 
 
 
-
 
NC_002936  DET1434  hydrogenase expression/formation protein HypD  40 
 
 		 364 aa  281  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.736513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1216  hydrogenase maturation factor  40 
 
 		 364 aa  281  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2010  hydrogenase expression/formation  44.38 
 
 		 375 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1169  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.16 
 
 		 380 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.783843  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2361  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.43 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255752  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3877  hydrogenase expression/formation protein HypD  40.8 
 
 		 382 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.848874  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0530  hydrogenase formation HypD protein  42.53 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1947  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.93 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1242  hydrogenase expression/formation protein HypD  39.43 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0474  hydrogenase expression/formation  43.02 
 
 		 382 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982251  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0479  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.24 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.140537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2392  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.29 
 
 		 368 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1641  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.64 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1401  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.73 
 
 		 355 aa  277  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.416582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0308  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.24 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1783  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.14 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2778  hydrogenase expression/formation protein HypD  45.02 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1643  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.07 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3444  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.77 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33135  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3759  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.63 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1419  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.54 
 
 		 371 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03910  hydrogenase formation HypD protein  41.02 
 
 		 365 aa  275  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2405  hydrogenase expression/formation protein HypD  41.83 
 
 		 366 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3925  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.44 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.547709  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08040  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.71 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1070  hydrogenase expression/formation protein HypD  42 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.250969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2538  hydrogenase expression/formation protein HypD  42.81 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0930  hydrogenase formation HypD protein  40.35 
 
 		 375 aa  271  8.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3210  hydrogenase expression/formation protein HypD  44.18 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4557  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.47 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2525  hydrogenase expression/formation protein HypD  43.68 
 
 		 371 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>