62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1795 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  741    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  82.11 
 
 
3295 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  52.55 
 
 
787 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  49.54 
 
 
848 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  44.13 
 
 
682 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  42.11 
 
 
653 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  41.04 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  41.83 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  41.86 
 
 
670 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.01 
 
 
2554 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.26 
 
 
1732 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  45.21 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  38.49 
 
 
276 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  35.11 
 
 
272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  56.84 
 
 
831 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  68.06 
 
 
676 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  67.12 
 
 
749 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  62.5 
 
 
958 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  62.65 
 
 
930 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  39.13 
 
 
298 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  58.82 
 
 
488 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  34.34 
 
 
298 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  58.02 
 
 
668 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  67.65 
 
 
579 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.27 
 
 
547 aa  99.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  55.42 
 
 
1056 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  58.67 
 
 
869 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  54.95 
 
 
479 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  41.18 
 
 
468 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  58.23 
 
 
735 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  61.43 
 
 
919 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  64.29 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  59.46 
 
 
294 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  63.38 
 
 
697 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  61.97 
 
 
698 aa  96.3  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  70.49 
 
 
522 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  61.19 
 
 
581 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  59.49 
 
 
709 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  67.16 
 
 
627 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  60.56 
 
 
389 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  53.33 
 
 
739 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  53.16 
 
 
522 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  55.56 
 
 
479 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  68.33 
 
 
561 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  55.13 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  59.72 
 
 
391 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  60.94 
 
 
403 aa  87  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  58.82 
 
 
110 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  78 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  56.72 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  49.32 
 
 
528 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  50.72 
 
 
595 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  51.72 
 
 
472 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  55.56 
 
 
887 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  53.12 
 
 
884 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  51.56 
 
 
883 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.54 
 
 
594 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  48.39 
 
 
248 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0257  hypothetical protein  51.72 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 
975 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.36 
 
 
1531 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  42.86 
 
 
720 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>