More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0574 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0574  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
375 aa  751    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.194056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
968 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
935 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0236  putative PAS/PAC sensor protein  32.29 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
974 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
589 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
896 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
862 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
651 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
1032 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
638 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
653 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
563 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
931 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.927247  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
439 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
644 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
1111 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1647  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
638 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211834  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
656 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
968 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
472 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
813 aa  143  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
596 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
1301 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
569 aa  142  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2061  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.05 
 
 
600 aa  142  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.658977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
736 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
1039 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
783 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
931 aa  139  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
1325 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
1055 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2965  histidine kinase  33.33 
 
 
350 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
813 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
763 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
1050 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
1121 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2200  histidine kinase  35.09 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
844 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.73 
 
 
524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
472 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
608 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1231  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
366 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0108298  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
781 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
1078 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0999  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0658985  normal  0.43266 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
901 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
1425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
657 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
1426 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
765 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
1513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
771 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
655 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
639 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
720 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
619 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
886 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0935  histidine kinase  35.74 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.957792  normal  0.0100677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
431 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 
347 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
544 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
566 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
603 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
1069 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
593 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
510 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
768 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
530 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
890 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
619 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
678 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2683  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
372 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200357  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
1439 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
753 aa  123  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
1225 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
766 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
873 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
1758 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
732 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
1276 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
841 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
737 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
481 aa  121  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
660 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1265 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
789 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
2072 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2676  histidine kinase  34.42 
 
 
213 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2719  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
586 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000435656  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
574 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>