186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2572 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 161 aa  322  9e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.78 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.74 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  51.85 
 
 		 120 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5130  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  38.51 
 
 		 171 aa  94  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4391  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.2 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 1038 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 629 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 1252 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.4 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 1252 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1309  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  31.37 
 
 		 252 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14850  type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  30.67 
 
 		 252 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1121 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.28 
 
 		 745 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  37.78 
 
 		 667 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  35.53 
 
 		 643 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 2240 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 512 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.12 
 
 		 576 aa  48.5  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 585 aa  48.5  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 632 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 824 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0892  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 330 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000556598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  43.28 
 
 		 623 aa  47.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 351 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 927 aa  47.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.94 
 
 		 863 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 543 aa  47.4  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 		 637 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2882  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 767 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 364 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  34.41 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  34.18 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 3145 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3012  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.42 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 409 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 621 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 4079 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.03 
 
 		 880 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  30.53 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  32.08 
 
 		 577 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  27.22 
 
 		 395 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1276 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  31.65 
 
 		 336 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  30.3 
 
 		 253 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 662 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 409 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 294 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 		 340 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2822  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 257 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01054  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.97 
 
 		 262 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.5978  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 1600 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 		 979 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 465 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 636 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0465  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 467 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06112  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  31.97 
 
 		 262 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3963  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 264 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.187703 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 265 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0342  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 298 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 249 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 612 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 1024 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 249 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 522 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  43.08 
 
 		 650 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.13 
 
 		 810 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1827 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0298  hypothetical protein  35.14 
 
 		 281 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3051  tetratricopeptide TPR_4  45 
 
 		 499 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 243 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1450 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  32.69 
 
 		 577 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 931 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 393 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  35.96 
 
 		 530 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.69 
 
 		 249 aa  43.9  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.69 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 377 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 		 394 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 572 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1901  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.856329  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 542 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25 
 
 		 820 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 265 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.69 
 
 		 249 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 319 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  32.47 
 
 		 737 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.07 
 
 		 884 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 399 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>