118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3810 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3810  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 934 aa  1924    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0593009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0997  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 935 aa  301  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01453  predicted porin protein  27.72 
 
 		 790 aa  295  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01466  hypothetical protein  27.72 
 
 		 790 aa  295  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1580  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 790 aa  293  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1685  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 790 aa  293  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2162  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 790 aa  293  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2108  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 790 aa  291  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347716  normal  0.376393 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2151  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 790 aa  291  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1678  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 790 aa  291  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1759  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 790 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.949304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3287  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 856 aa  278  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0760  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 867 aa  264  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0932  putative TonB dependent receptor  27.14 
 
 		 859 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.175288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  26.26 
 
 		 862 aa  239  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1224  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 908 aa  179  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.735079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0894  hypothetical protein  27 
 
 		 488 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0447  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.9 
 
 		 841 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000427237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1947  hypothetical protein  21.35 
 
 		 859 aa  158  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2599  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 840 aa  154  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0846  TonB-dependent receptor, plug  35.96 
 
 		 879 aa  104  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.44 
 
 		 859 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.29 
 
 		 867 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.94 
 
 		 861 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  36 
 
 		 793 aa  67.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  37.62 
 
 		 797 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 835 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  22.74 
 
 		 857 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.85 
 
 		 862 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 864 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 814 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 808 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 815 aa  55.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 821 aa  55.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 822 aa  54.7  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 828 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  33.68 
 
 		 829 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 803 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.6 
 
 		 799 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0893  hypothetical protein  20.61 
 
 		 266 aa  52.8  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0658  secretin/TonB  34.26 
 
 		 507 aa  52.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 824 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  43.08 
 
 		 774 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  38.82 
 
 		 774 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2303  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 982 aa  51.6  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243733  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.24 
 
 		 833 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  30.83 
 
 		 808 aa  51.6  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 		 879 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 817 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  34.15 
 
 		 828 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  34.88 
 
 		 889 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 808 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 822 aa  50.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  36.36 
 
 		 798 aa  50.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  30.7 
 
 		 810 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  43.64 
 
 		 831 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0896  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 149 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.221144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 833 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 		 821 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  32.69 
 
 		 777 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2220  Secretin/TonB short domain  26.09 
 
 		 226 aa  50.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5620  putative extracellular heme-binding protein  30.77 
 
 		 930 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.91 
 
 		 862 aa  48.9  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.71 
 
 		 804 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 921 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 921 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4301  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 1018 aa  48.5  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.15211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3699  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.94 
 
 		 1186 aa  48.5  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0724462  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 881 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 881 aa  48.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  38.57 
 
 		 881 aa  48.1  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2186  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 1040 aa  48.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.996858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 794 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 829 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64710  putative extracellular heme-binding protein  31.46 
 
 		 989 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.572363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  32.93 
 
 		 828 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 804 aa  47.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  30.4 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 806 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 808 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  30.53 
 
 		 802 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1074 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2679  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 1054 aa  47  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 791 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 810 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.7 
 
 		 862 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 817 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 797 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  23.87 
 
 		 992 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 808 aa  46.2  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  34.38 
 
 		 784 aa  46.2  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 819 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 797 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  29.03 
 
 		 812 aa  45.8  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 797 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>