191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0155 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  803    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  803    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  97.79 
 
 
408 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  69.8 
 
 
404 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  69.44 
 
 
405 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  63.57 
 
 
423 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  33.02 
 
 
520 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  30.19 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  32.67 
 
 
467 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  31.31 
 
 
466 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  30.93 
 
 
450 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  31.92 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  28.34 
 
 
459 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  31.46 
 
 
434 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  26.28 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
455 aa  86.7  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  24.64 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  32.38 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  31.64 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.73 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  27.52 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  30.56 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  34.16 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  28.91 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  28.88 
 
 
638 aa  67.4  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  29.32 
 
 
641 aa  67  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.9 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.5 
 
 
446 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  24.39 
 
 
295 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  23.56 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
528 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  25.37 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.23 
 
 
295 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.32 
 
 
328 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  21.07 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  26.92 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  28.09 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  27.78 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  27.56 
 
 
286 aa  60.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  27.64 
 
 
308 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  34.15 
 
 
298 aa  59.7  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  28.57 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0461  hypothetical protein  26.4 
 
 
287 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.89 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  29.84 
 
 
296 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
294 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  27.82 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1880  conserved repeat domain protein  28.04 
 
 
652 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  29.92 
 
 
575 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  28.3 
 
 
448 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2677  hypothetical protein  24.48 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  26.92 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  28.23 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2415  conserved repeat domain protein  29.69 
 
 
638 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  24.2 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.14 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.69 
 
 
296 aa  54.3  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  24.31 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  29.03 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3946  conserved repeat domain protein  31.95 
 
 
828 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  24.46 
 
 
303 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  26.7 
 
 
444 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  36.36 
 
 
341 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  25 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.42 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 
469 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  25.28 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  29.41 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  26.72 
 
 
295 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.83 
 
 
309 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  32.74 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  28.19 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3029  hypothetical protein  32.18 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  0.142449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  28.57 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  38.89 
 
 
323 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  24.48 
 
 
300 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  22.88 
 
 
292 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  21.55 
 
 
291 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02703  hypothetical protein  24.64 
 
 
324 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.31 
 
 
432 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.35 
 
 
350 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  42.62 
 
 
302 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  28.83 
 
 
436 aa  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.37 
 
 
292 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  24.8 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2136  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412717  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  24.41 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  42.62 
 
 
312 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  29.69 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  28.03 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25.73 
 
 
308 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  28.91 
 
 
353 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  21.53 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0096  hypothetical protein  31.43 
 
 
336 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  42.62 
 
 
316 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  32.76 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>