161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0659 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 322 aa  640    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  95.65 
 
 		 322 aa  616  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  94.1 
 
 		 322 aa  614  1e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  75.16 
 
 		 324 aa  500  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  46.82 
 
 		 1682 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.1 
 
 		 2122 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  48.79 
 
 		 486 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  36.45 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  36.12 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.84 
 
 		 1383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  36.64 
 
 		 463 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  35.06 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  35.61 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 963 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 546 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 		 432 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 687 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 		 652 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  30.7 
 
 		 653 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  31.07 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  29.19 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 		 774 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.92 
 
 		 484 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  32.08 
 
 		 457 aa  123  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  33.83 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.95 
 
 		 1454 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 795 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 		 365 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 861 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  31.4 
 
 		 450 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32.17 
 
 		 371 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  28.38 
 
 		 514 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  25 
 
 		 901 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  24.05 
 
 		 603 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  29.55 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  23.61 
 
 		 487 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 		 412 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 		 603 aa  86.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  32.82 
 
 		 371 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  26.54 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  29.31 
 
 		 1812 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  26.78 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.81 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.85 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  24.85 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  28.07 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  23.33 
 
 		 619 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  23.49 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  24.32 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  25.46 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  23.08 
 
 		 705 aa  66.6  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  29.87 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  24.29 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  23.2 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  29.87 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  25.07 
 
 		 848 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  29.07 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  28.02 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  27.94 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  20.59 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  25.13 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  18.53 
 
 		 643 aa  59.7  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 834 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  24.82 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  26.36 
 
 		 645 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.49 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  27.47 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7435  hypothetical protein  25.56 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  24.55 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4046  hypothetical protein  25.56 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00161846  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  23.03 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  25.07 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  23.26 
 
 		 616 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  24.78 
 
 		 408 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  23.29 
 
 		 395 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  23.29 
 
 		 395 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 		 630 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  25.64 
 
 		 417 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  23.22 
 
 		 656 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  30.89 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.89 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.02 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.89 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.89 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.89 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.89 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  30.89 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  25.08 
 
 		 516 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0883  Pyrrolo-quinoline quinone  21.21 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0722286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.53 
 
 		 2272 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  22.9 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  24.44 
 
 		 440 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.99 
 
 		 392 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  30.89 
 
 		 392 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2036 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>