More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1520 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  62.03 
 
 		 593 aa  761    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  63.42 
 
 		 593 aa  781    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 589 aa  1187    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  64.29 
 
 		 604 aa  783    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  53.47 
 
 		 591 aa  641    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  64.68 
 
 		 591 aa  792    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  53.91 
 
 		 602 aa  633  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  52.45 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  50 
 
 		 599 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  51.11 
 
 		 578 aa  585  1e-166  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 		 597 aa  579  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  49.32 
 
 		 607 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  49.15 
 
 		 604 aa  557  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  48.64 
 
 		 602 aa  542  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 598 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  46.58 
 
 		 598 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  45.99 
 
 		 598 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  46.91 
 
 		 598 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  47.99 
 
 		 598 aa  501  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  43.62 
 
 		 597 aa  485  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  46.31 
 
 		 601 aa  479  1e-134  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  44.22 
 
 		 600 aa  478  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  43.19 
 
 		 592 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  43.05 
 
 		 589 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  43.7 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  43.24 
 
 		 594 aa  459  9.999999999999999e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  42.81 
 
 		 588 aa  461  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  42.47 
 
 		 592 aa  450  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  38.97 
 
 		 1072 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  39.02 
 
 		 1228 aa  365  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  36.77 
 
 		 623 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  36.13 
 
 		 997 aa  347  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.37 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  30.45 
 
 		 692 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 		 924 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.2 
 
 		 854 aa  179  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  28.37 
 
 		 705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  29.76 
 
 		 693 aa  172  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  28.8 
 
 		 720 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  29.27 
 
 		 688 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  30.29 
 
 		 885 aa  171  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 686 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  28.57 
 
 		 686 aa  170  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  30.56 
 
 		 912 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  30.89 
 
 		 894 aa  169  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 		 882 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  29.51 
 
 		 882 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.77 
 
 		 903 aa  169  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  28.11 
 
 		 686 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 		 688 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  29.91 
 
 		 690 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  27.93 
 
 		 689 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  29.97 
 
 		 843 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 		 896 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  28.9 
 
 		 985 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 		 658 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  29.97 
 
 		 869 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  27.99 
 
 		 853 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  29.24 
 
 		 673 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  29.27 
 
 		 903 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  29.33 
 
 		 601 aa  165  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  28.77 
 
 		 686 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  29.02 
 
 		 711 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  30.14 
 
 		 884 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  28.55 
 
 		 880 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  28.93 
 
 		 1042 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  28.89 
 
 		 885 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 		 874 aa  163  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  30.42 
 
 		 885 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2710  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 992 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3393  translation initiation factor IF-2  28.45 
 
 		 992 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.718402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  28.84 
 
 		 885 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  28.84 
 
 		 885 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  27.29 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1025  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 1183 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.24 
 
 		 1104 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  27.62 
 
 		 822 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  29.26 
 
 		 908 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  29.47 
 
 		 881 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 		 928 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  28.48 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1679  translation initiation factor IF-2  28.99 
 
 		 914 aa  161  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.010886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  28.72 
 
 		 889 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18951  translation initiation factor IF-2  28.6 
 
 		 1183 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  29.02 
 
 		 845 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  29.09 
 
 		 908 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  30.07 
 
 		 896 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  29.51 
 
 		 921 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  28.98 
 
 		 1176 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  28.33 
 
 		 868 aa  160  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  27.9 
 
 		 1128 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  28.69 
 
 		 1030 aa  160  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>