150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2677 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2677  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  433  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.05 
 
 
1426 aa  228  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  47.9 
 
 
565 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2082  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  31.43 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0339315  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 
1399 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
1516 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
1099 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0530  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.85 
 
 
961 aa  68.6  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.639569  normal  0.653911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1042  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.78 
 
 
1059 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.192885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0074  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.01 
 
 
857 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.102755  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
739 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 
1927 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0985  sensory box protein  28.7 
 
 
976 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.928504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
1433 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
914 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  31.58 
 
 
454 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1040 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0537  sensory box/GGDEF family protein  31.3 
 
 
682 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2531  sensory box histidine kinase  32.11 
 
 
1053 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.606569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3721  histidine kinase  29.11 
 
 
468 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.620219  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.9 
 
 
669 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1322 aa  62.8  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.81 
 
 
965 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.38 
 
 
1225 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.63 
 
 
1251 aa  61.6  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
1226 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
1758 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.46 
 
 
1115 aa  58.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00704  sensory box/GGDEF/EAL domain protein  27.48 
 
 
852 aa  58.9  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1116 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
1676 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
986 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  23.75 
 
 
1055 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  31.9 
 
 
1333 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  28.39 
 
 
866 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 
1313 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6278  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.26 
 
 
1064 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.719663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
968 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.33 
 
 
1101 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2501  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.56 
 
 
452 aa  55.1  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.460244  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  32.71 
 
 
704 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1741  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
857 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.99373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
535 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
1322 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 
914 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
947 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.92 
 
 
532 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.64 
 
 
1560 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.82 
 
 
696 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0252232  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
735 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
1279 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 
1977 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0312  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.64 
 
 
454 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
1229 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
907 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0059  GGDEF family protein  32.26 
 
 
611 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
1039 aa  52  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1058 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  26.38 
 
 
1248 aa  51.6  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2695  hypothetical protein  31.63 
 
 
835 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001429  GGDEF family protein  31.33 
 
 
606 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000304486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 
865 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  25.86 
 
 
956 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
591 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
869 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1743  sensory box protein  25.47 
 
 
719 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
1118 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  23.6 
 
 
930 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1046  putative diguanylate cyclase  30.09 
 
 
559 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.25674  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2222  diguanylate cyclase  30.28 
 
 
847 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.162543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
1090 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1620  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.79 
 
 
927 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
665 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0600  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 
727 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000188746  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02606  putative lipoprotein transmembrane  32.77 
 
 
478 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368368  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
2693 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  27.48 
 
 
918 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3063  diguanylate cyclase  27.07 
 
 
1003 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964207  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2569  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.77 
 
 
509 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.393427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
616 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
784 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
896 aa  47.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  30.07 
 
 
1251 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3287  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.07 
 
 
1003 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.51 
 
 
1070 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1965 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  27.59 
 
 
1561 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  27.01 
 
 
497 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4242  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  25.52 
 
 
660 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0067  histidine kinase  41.54 
 
 
486 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.96 
 
 
958 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2666  putative sensor protein  29.13 
 
 
1129 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2253  Fis family transcriptional regulator  25.81 
 
 
648 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1826  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.07 
 
 
1294 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
1069 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1215 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2575  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.52 
 
 
566 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
514 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1669 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 
1300 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>