More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2216 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  100 
 
 
466 aa  918    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  57.08 
 
 
492 aa  487  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  55.7 
 
 
474 aa  485  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  55.86 
 
 
487 aa  482  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  53.38 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  48.44 
 
 
465 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  48.22 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  48.89 
 
 
465 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  46.88 
 
 
461 aa  412  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  48.25 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  48.77 
 
 
456 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  48.77 
 
 
456 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  48.99 
 
 
456 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
462 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  46.55 
 
 
475 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  42.63 
 
 
458 aa  335  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  38.36 
 
 
479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
497 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  37.69 
 
 
467 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
453 aa  317  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  40.27 
 
 
453 aa  309  9e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  37 
 
 
463 aa  300  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  36.4 
 
 
466 aa  293  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
474 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  36.28 
 
 
469 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  34.81 
 
 
467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 
475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 
459 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.05 
 
 
477 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.05 
 
 
522 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.4 
 
 
474 aa  223  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.34 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 
456 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.22 
 
 
482 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 
477 aa  207  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 
475 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.61 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.14 
 
 
483 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  34.37 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  32.97 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.27 
 
 
483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
493 aa  197  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  31.03 
 
 
526 aa  196  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
478 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.54 
 
 
469 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.36 
 
 
496 aa  190  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 
482 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.83 
 
 
501 aa  186  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 
493 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  31.52 
 
 
462 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  32.91 
 
 
444 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 
478 aa  180  5.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
476 aa  180  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.88 
 
 
529 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 
505 aa  179  8e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 
486 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  30.17 
 
 
477 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 
461 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.33 
 
 
512 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.45 
 
 
478 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 
502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  30.08 
 
 
488 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.75 
 
 
525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0598  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459101  normal  0.0687565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.9 
 
 
500 aa  173  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.97 
 
 
477 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 
534 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.24 
 
 
478 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  32.04 
 
 
490 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  33.12 
 
 
445 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  29.4 
 
 
446 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.66 
 
 
455 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
455 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.15 
 
 
509 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 
534 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  31.69 
 
 
476 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.07 
 
 
469 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 
528 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 
503 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  31.77 
 
 
457 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  28.67 
 
 
458 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 
472 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  29.07 
 
 
469 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.16 
 
 
478 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 
505 aa  167  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 
482 aa  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  33.42 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  33.42 
 
 
457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  30.23 
 
 
490 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  30.37 
 
 
459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 
457 aa  166  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  33.16 
 
 
457 aa  166  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  33.16 
 
 
457 aa  166  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  33.16 
 
 
457 aa  166  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  33.16 
 
 
457 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>