More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1950 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  100 
 
 
461 aa  903    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  48.67 
 
 
492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  49.22 
 
 
472 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  46.88 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  45.83 
 
 
465 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  45.61 
 
 
465 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  47.11 
 
 
487 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  46.9 
 
 
474 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1276  major facilitator family transporter  45.51 
 
 
465 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0457752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  42.11 
 
 
456 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  43.67 
 
 
467 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  41.23 
 
 
456 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  40.13 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1452  major facilitator transporter  42.79 
 
 
475 aa  334  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  41.78 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  44.05 
 
 
462 aa  319  7.999999999999999e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  37.67 
 
 
453 aa  301  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
453 aa  299  7e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 
466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  37.69 
 
 
467 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  35.87 
 
 
479 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3169  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
462 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2645  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000155318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  32.81 
 
 
463 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  35.9 
 
 
469 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0206  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
446 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  34.83 
 
 
467 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.18 
 
 
474 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 
475 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.79 
 
 
465 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.25 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 
482 aa  193  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.84 
 
 
477 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 
493 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.01 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 
493 aa  183  6e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.84 
 
 
461 aa  183  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 
456 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 
486 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 
482 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 
471 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.19 
 
 
462 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.62 
 
 
483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.07 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 
478 aa  172  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2007  major facilitator superfamily MFS_1  30.54 
 
 
459 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.930044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0891  major facilitator transporter  32.35 
 
 
470 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.25 
 
 
467 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 
483 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1762  major facilitator transporter  29.2 
 
 
477 aa  170  5e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 
478 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 
484 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 
478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.35 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.37 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 
478 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  30.52 
 
 
516 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
573 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.6 
 
 
488 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
534 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  31.15 
 
 
462 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  29.02 
 
 
478 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1536  major facilitator superfamily permease  31.59 
 
 
458 aa  161  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 
477 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 
496 aa  161  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  28.61 
 
 
462 aa  161  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  30.89 
 
 
473 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0390  hypothetical protein  29.64 
 
 
526 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00612987  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.55 
 
 
502 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.75 
 
 
478 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 
607 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 
529 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  33.42 
 
 
537 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0049  major facilitator transporter  32.69 
 
 
560 aa  159  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 
458 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
476 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0528  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.29 
 
 
469 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.402464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8983  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.2 
 
 
495 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 
478 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  28.88 
 
 
520 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.53 
 
 
474 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 
498 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.85 
 
 
482 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
458 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.54 
 
 
459 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 
503 aa  156  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2257  major facilitator transporter  31.89 
 
 
589 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0355972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  27.98 
 
 
470 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 
506 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
491 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 
493 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 
472 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
445 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>