More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3721 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3721  luciferase-like  100 
 
 
389 aa  818    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  57.67 
 
 
405 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  44.94 
 
 
387 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  45.48 
 
 
388 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  44.33 
 
 
391 aa  340  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5158  luciferase family protein  44.7 
 
 
396 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.159599  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4772  luciferase-like protein  44.44 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4858  luciferase family protein  44.44 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13649  monooxygenase  43.73 
 
 
395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.486849  hitchhiker  0.000284766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  44.67 
 
 
413 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  29.84 
 
 
369 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  29.65 
 
 
369 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  29.67 
 
 
366 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  29.04 
 
 
368 aa  136  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  30.39 
 
 
365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  30.18 
 
 
353 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  32.35 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  29.96 
 
 
355 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0220  luciferase family protein  35.42 
 
 
360 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  30.5 
 
 
374 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1468  luciferase-like  27.91 
 
 
366 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.839714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.64 
 
 
362 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  29.74 
 
 
334 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  32.14 
 
 
380 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  27.94 
 
 
365 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  32.49 
 
 
327 aa  100  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  31.51 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  29.37 
 
 
334 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.15 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  25.62 
 
 
352 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  28.2 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  34.07 
 
 
439 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  29.41 
 
 
377 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  32.49 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  34.43 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  34.43 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  34.43 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  27.33 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.24 
 
 
346 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  25.74 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  27.94 
 
 
352 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 
329 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  24.69 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  29.81 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  32.5 
 
 
315 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  25.27 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  34.44 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  38.05 
 
 
348 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  23.03 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  26.88 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  26.77 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  25.52 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  26.45 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  27.18 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  26.6 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.55 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.06 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  27.18 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  26.07 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.16 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.67 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  27.05 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  23.96 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  36.21 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.16 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.52 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  26.37 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  39.22 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5748  luciferase family protein  34.15 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  hitchhiker  0.000000000857143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  35.34 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.07 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9288  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  25.54 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.862144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  28.57 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  23.75 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  30.64 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.65 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  25.51 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  30.64 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  25.83 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  22.99 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  26.33 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  23.87 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  33.88 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0182  luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1589  luciferase-like monooxygenase  37.1 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2315  Luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.447599  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4358  luciferase family protein  32.43 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  25.23 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  23.31 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  25.55 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  26.03 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.74 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  34.21 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6173  luciferase family protein  27.38 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479672  normal  0.0665211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07710  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  38.95 
 
 
322 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  28.95 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1053  luciferase family protein  39.22 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  21.88 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>