More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2390 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  78.91 
 
 		 260 aa  414  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  40.4 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  41.34 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  40.4 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  41.49 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.47 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  39.43 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  36.69 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  38.98 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  36.69 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.52 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  42.4 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34.27 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  40.17 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  40.24 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  38.62 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  40.73 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.2 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  36.59 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  40.31 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  35.48 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.18 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  37.08 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  36.59 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  38.98 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  40.09 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.21 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  38.37 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  34.94 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  37.61 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2706  transcriptional regulator, DeoR family  35.22 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  33.73 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  41.48 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 263 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  36.84 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  31.87 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>