More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0900 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  63.11 
 
 
122 aa  164  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  52.07 
 
 
135 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  51.24 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 
373 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
384 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  50 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  45.16 
 
 
429 aa  116  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  47.54 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  49.17 
 
 
257 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.83 
 
 
704 aa  115  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  48.76 
 
 
261 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 
255 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  47.11 
 
 
240 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  43.8 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 
455 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
498 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 
455 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.61 
 
 
953 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 
355 aa  110  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  50.42 
 
 
701 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  47.01 
 
 
265 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  43.2 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 
591 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
343 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
989 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  46.55 
 
 
245 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
989 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.11 
 
 
256 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  43.2 
 
 
316 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
386 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  45.76 
 
 
458 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
450 aa  105  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.02 
 
 
701 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  42.4 
 
 
263 aa  104  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  44.54 
 
 
404 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
377 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  42.4 
 
 
238 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  44.72 
 
 
127 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
472 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 
603 aa  100  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
450 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
636 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  45 
 
 
469 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  39.37 
 
 
461 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
258 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
359 aa  98.2  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
376 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
521 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  39.29 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 
380 aa  97.1  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  38.02 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 
429 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  37.39 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  43.55 
 
 
311 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.83 
 
 
457 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.83 
 
 
426 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  39.67 
 
 
387 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 
651 aa  93.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
182 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  44.09 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
336 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
817 aa  92.8  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 
571 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
463 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 
474 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 
457 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  39.13 
 
 
657 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 
337 aa  88.2  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 
635 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 
461 aa  87  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.03 
 
 
650 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
355 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
248 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 
196 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 
248 aa  84  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  30.89 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2711  two component signal transduction response regulator  36.44 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.39 
 
 
471 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 
481 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.5 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  35 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  38.33 
 
 
798 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  38.26 
 
 
667 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  44.44 
 
 
273 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  39.13 
 
 
207 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.17 
 
 
561 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.67 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  35 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35 
 
 
432 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.19 
 
 
582 aa  77  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  33.91 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  35.9 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  35.34 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1012  response regulator receiver domain-containing protein  36.19 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.82 
 
 
226 aa  74.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>