More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0166 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  787    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  52.41 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  33.25 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  34.01 
 
 
411 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  30.89 
 
 
403 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  30.38 
 
 
405 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 
400 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
406 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  32.49 
 
 
399 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
403 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.69 
 
 
386 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.31 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  23.69 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.02 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  26.05 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.75 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.44 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  23.41 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.99 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  31.29 
 
 
885 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  26.27 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  23.68 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.25 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.58 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.88 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.45 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.3 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  27.78 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  26.12 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 
878 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  24.55 
 
 
403 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 
852 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  24.81 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  27.86 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  30.82 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  34.51 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  26.61 
 
 
381 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  26.44 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  29.44 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  34.51 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  25.85 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  38.6 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  24.85 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.8 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.56 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  38.05 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  27.74 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  25.68 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  27.57 
 
 
643 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.52 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 
413 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  37.66 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  36.21 
 
 
404 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
386 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.12 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.5 
 
 
1207 aa  61.2  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  29.54 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  29.19 
 
 
654 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.36 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  28.19 
 
 
1130 aa  60.8  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  38.93 
 
 
401 aa  60.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  29.34 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  32.28 
 
 
779 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.51 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  32.54 
 
 
903 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  27.92 
 
 
400 aa  60.1  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.1 
 
 
387 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 
411 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  27.64 
 
 
394 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  33.63 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.29 
 
 
408 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  28.93 
 
 
421 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.17 
 
 
397 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  26.56 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  27.67 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  35.65 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  33.63 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  31.58 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  33.63 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  24.78 
 
 
488 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  23.76 
 
 
400 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.51 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>