149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0625 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  100 
 
 
405 aa  822    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 
403 aa  410  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  37.24 
 
 
403 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  33.42 
 
 
403 aa  246  4e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  28.5 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  30.38 
 
 
395 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
399 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 
400 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  26.38 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 
400 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 
406 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.18 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  20.75 
 
 
386 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  21.11 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  33.06 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  20.84 
 
 
386 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  20.14 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  28.7 
 
 
851 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  30.91 
 
 
903 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.78 
 
 
1090 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  21.89 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  34.21 
 
 
866 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.77 
 
 
858 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  23.24 
 
 
856 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  21.39 
 
 
857 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.89 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  36.14 
 
 
848 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  28.83 
 
 
1207 aa  51.2  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.63 
 
 
850 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  30.67 
 
 
873 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  31.68 
 
 
385 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  25.5 
 
 
885 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  39.06 
 
 
947 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  31.61 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  31.61 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  31.61 
 
 
391 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 
849 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  19.72 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  30.89 
 
 
842 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 
1016 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  31.58 
 
 
863 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  30.97 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  23.32 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.61 
 
 
835 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
384 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.51 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
853 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.44 
 
 
873 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  20.35 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  30.97 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  27.35 
 
 
1130 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.94 
 
 
846 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  30 
 
 
641 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  33.86 
 
 
641 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  30.32 
 
 
391 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  24.61 
 
 
399 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  26.82 
 
 
828 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.72 
 
 
870 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 
391 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  33.33 
 
 
653 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  24.58 
 
 
406 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 
859 aa  46.6  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.62 
 
 
408 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 
849 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.33 
 
 
805 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.66 
 
 
841 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  22.98 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  29.25 
 
 
791 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  25.19 
 
 
819 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.33 
 
 
641 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  24.58 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  24.58 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  24.24 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  26.81 
 
 
779 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  37.21 
 
 
834 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  30.47 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.14 
 
 
488 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  21.49 
 
 
397 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  24.58 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 
792 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.4 
 
 
646 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  29.13 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.58 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  29.13 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.58 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.58 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  30.69 
 
 
871 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  27.53 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.21 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>