159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1518 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1518  permease, putative  100 
 
 		 403 aa  810    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  36.27 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  33.42 
 
 		 405 aa  239  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  33.51 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  35.24 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  30.63 
 
 		 411 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  21.16 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  22.26 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  23.96 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.64 
 
 		 855 aa  67.4  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  20.97 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  21.35 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  22.96 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.59 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  22.37 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  22.92 
 
 		 854 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.28 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  22.18 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  30.53 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  24.94 
 
 		 843 aa  57  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  22.6 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  21.05 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0477  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 		 835 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  22.17 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  26.57 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  22.17 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.5 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  19.7 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  28.64 
 
 		 643 aa  53.5  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  20.53 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.11 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  20.18 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  21.93 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 852 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  24.74 
 
 		 842 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  22.16 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  21.12 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  20.69 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  29.36 
 
 		 643 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  21.12 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  21.12 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.31 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.54 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 859 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  20.51 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.45 
 
 		 857 aa  50.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  24.15 
 
 		 896 aa  49.7  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 640 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  20.61 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 644 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  20.94 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.47 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 640 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 643 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 640 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2428  permease  26.85 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0996283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 640 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.28 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  21.68 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  25.31 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  20.99 
 
 		 787 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  26.85 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.87 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.62 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 643 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 		 640 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  26.85 
 
 		 641 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.07 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  31.67 
 
 		 855 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  27.34 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.41 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  26.45 
 
 		 430 aa  47.4  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  31.67 
 
 		 640 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1850  ABC transporter, permease protein, putative  22.53 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  24.55 
 
 		 827 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  19.66 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0922  hypothetical protein  22.62 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.696893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  27.97 
 
 		 919 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  24.45 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.88 
 
 		 807 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  23.72 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  26.48 
 
 		 847 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  18.62 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  20.51 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  29.49 
 
 		 857 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>