42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2015 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  826    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  44.02 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  34.01 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  28.78 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  29.57 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  26.38 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 399 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.57 
 
 		 827 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  23.19 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  26.97 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.59 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  22.69 
 
 		 794 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  21.67 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  29.46 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.84 
 
 		 850 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  22.31 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  26.12 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  24.29 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  28.97 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.32 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  34.09 
 
 		 934 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  25.95 
 
 		 797 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  29.17 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  22.79 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.51 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  32.93 
 
 		 779 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 		 822 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.73 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  29.08 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  26.19 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  23.88 
 
 		 947 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  33.83 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.32 
 
 		 863 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  33.64 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>