119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0367 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0367  efflux ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 403 aa  815    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0625  ABC-type transport system for lysophospholipase L1 biosynthesis permease  53.62 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0260119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  36.72 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  35 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  31.04 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  30.52 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  29.18 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2015  hypothetical protein  27.43 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0449562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1922  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 		 400 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3893  protein of unknown function DUF214  24.74 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 378 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  26.05 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 		 857 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  33.53 
 
 		 846 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  22.95 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  20.37 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  28.31 
 
 		 855 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  23.44 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  27.69 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  21.23 
 
 		 401 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  23.26 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  21.26 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  22.81 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  27.91 
 
 		 1130 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  22.34 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.19 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  21.53 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  21.53 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  21.53 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.37 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  42.47 
 
 		 408 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  24.05 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.56 
 
 		 893 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  22.07 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  22.7 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  30.87 
 
 		 877 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  29.31 
 
 		 903 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  25.78 
 
 		 394 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  26.96 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  30.1 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  27.01 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  30.5 
 
 		 858 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  37.66 
 
 		 866 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  25.89 
 
 		 841 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  29.84 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4658  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 638 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.82 
 
 		 863 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  26.84 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.99 
 
 		 371 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.95 
 
 		 827 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  30.77 
 
 		 385 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  42.86 
 
 		 856 aa  46.6  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  26.56 
 
 		 395 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  26.61 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  25.53 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  32.8 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3582  protein of unknown function DUF214  34.33 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 852 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  24.31 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.01 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  27.34 
 
 		 1207 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  28.04 
 
 		 836 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09490  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.38 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.457964  normal  0.625524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  31.93 
 
 		 857 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.63 
 
 		 835 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  25.4 
 
 		 828 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.69 
 
 		 880 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 840 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  28.38 
 
 		 779 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 1016 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 		 877 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.14 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  22.22 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  22.29 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  32.41 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  25.71 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  22.16 
 
 		 847 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  30.39 
 
 		 825 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  31.58 
 
 		 779 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  24.13 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  35.05 
 
 		 626 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  35.05 
 
 		 626 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.03 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  28.68 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.47 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  24.11 
 
 		 876 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  38.1 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  31.34 
 
 		 849 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>