More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0165 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  63.18 
 
 
226 aa  270  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  51.6 
 
 
228 aa  221  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  51.82 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
228 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.98 
 
 
230 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 
234 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
253 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  47.27 
 
 
230 aa  204  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.64 
 
 
238 aa  204  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.55 
 
 
253 aa  204  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
228 aa  201  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  46.76 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  48.61 
 
 
224 aa  197  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.91 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  50.24 
 
 
236 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  44.04 
 
 
236 aa  195  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  43.18 
 
 
241 aa  194  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
227 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  43.64 
 
 
241 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  45.79 
 
 
228 aa  194  8.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  44.34 
 
 
226 aa  194  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.17 
 
 
237 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  46.76 
 
 
221 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  45.37 
 
 
228 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  44.5 
 
 
233 aa  192  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 
241 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  46.64 
 
 
233 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  46.33 
 
 
248 aa  191  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  44.44 
 
 
226 aa  191  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.64 
 
 
247 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  45 
 
 
240 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  42.79 
 
 
230 aa  190  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  45.91 
 
 
236 aa  189  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  42.27 
 
 
241 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  42.6 
 
 
228 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.37 
 
 
230 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  43.75 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  47.71 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
238 aa  188  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  188  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.25 
 
 
234 aa  188  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
234 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.09 
 
 
225 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  42.79 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.64 
 
 
233 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  42.73 
 
 
225 aa  188  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47 
 
 
236 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
223 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.27 
 
 
239 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.05 
 
 
235 aa  187  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.91 
 
 
244 aa  187  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.4 
 
 
258 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0905  ABC transporter related  46.4 
 
 
243 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.072369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.47 
 
 
227 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  43.58 
 
 
247 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.25 
 
 
260 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
220 aa  186  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.14 
 
 
234 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  44.55 
 
 
226 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  47.73 
 
 
228 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
221 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
238 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  44.04 
 
 
239 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
248 aa  185  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  43.06 
 
 
252 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
228 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
240 aa  185  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  45.37 
 
 
224 aa  184  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
236 aa  184  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  44.09 
 
 
650 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  47.47 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  45.41 
 
 
657 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  44.34 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  44.04 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.92 
 
 
642 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.74 
 
 
230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  42.47 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  43.84 
 
 
715 aa  182  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.66 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.69 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0544  ABC transporter related  46.76 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.59 
 
 
228 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  46.08 
 
 
255 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  42.2 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  43.98 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45 
 
 
226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45 
 
 
226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  40.74 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  43.89 
 
 
234 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.99 
 
 
640 aa  181  6e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  42.6 
 
 
237 aa  181  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  181  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
226 aa  181  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>