More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1563 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  53.21 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2007  ABC transporter related  46.58 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.148842  normal  0.501665 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0165  heme exporter protein CcmA  44.7 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0368  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 260 aa  184  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3894  ABC transporter related  43.64 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  38.12 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  41.55 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  40.83 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  41.44 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1091  ABC transporter related  39.81 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2503  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 253 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  38.25 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  38.29 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2307  ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00152592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2275  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2482  ABC transporter ATP-binding protein  39.46 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  40 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  38.84 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  41.87 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  39.63 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  36.82 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  40.72 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2513  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000518352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  42.79 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  39.46 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  39.73 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2229  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00449183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2578  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000371904  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.19 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  37.27 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  39.46 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  35.91 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  36.11 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  38.57 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  38.53 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  35.87 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2288  ABC transporter related  39.9 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1445  ABC transporter related  40.36 
 
 		 255 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  37.1 
 
 		 251 aa  161  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  38.39 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  38.53 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  38.53 
 
 		 660 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  39.55 
 
 		 240 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  41.36 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  38.25 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  37.04 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  41.36 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  36.99 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  41.55 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2730  ABC transporter related  37.44 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  37.73 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3550  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  37.27 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  36.82 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  35 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.07 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  39.73 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2204  ABC transporter, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  38.07 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  38.81 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  36.11 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  37.5 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  36.7 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  38.43 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6965  ABC transporter related  45.26 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  37.27 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.32 
 
 		 642 aa  158  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  39.91 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  39.55 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>