119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3068 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 210 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  38.81 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  39.18 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  41.54 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.79 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.79 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.79 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.35 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 224 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.11 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.76 
 
 		 212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  36.6 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.46 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.6 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.56 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.6 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.6 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.56 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.6 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  36.6 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.27 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.75 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.95 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.08 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.57 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.86 
 
 		 232 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  34.54 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.02 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.02 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.41 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.41 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  34 
 
 		 226 aa  98.2  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.06 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.2 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.62 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.84 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.84 
 
 		 204 aa  94.7  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 235 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.06 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.28 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  29.68 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.85 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  28.37 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  29.61 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  30.43 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  44 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>