231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2045 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  53.51 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  53.51 
 
 		 186 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  42.54 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  44.51 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  25.31 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 270 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 270 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 158 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  40 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3793  regulatory protein MarR  43.64 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  32 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4116  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 165 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 142 aa  48.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34950  MarR family regulatory protein  33.86 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  26.84 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  29.47 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  30.08 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  33.72 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  22.6 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  42.62 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  22.96 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>