68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03955 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 307 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  54.7 
 
 		 284 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  39.52 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  40.07 
 
 		 309 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  40.07 
 
 		 309 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  38.89 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  40.07 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  39.39 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  39.67 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  38.18 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  41.14 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  37.71 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  37.37 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  37.37 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  39.14 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  38.72 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  37.67 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  38.1 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  40.2 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  38.68 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  35.88 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  34.95 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  32.36 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  34.11 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  31.08 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  30.5 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1411  general secretion pathway protein C  30.92 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  30.61 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2861  general secretion pathway protein C  35.92 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1298  general secretion pathway protein C  25.85 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  29.96 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3248  putative type II secretion protein GspC  27.24 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3139  putative type II secretion protein GspC  26.44 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02789  hypothetical protein  26.74 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000559492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02839  predicted secretion pathway protein, C-type protein  26.74 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3428  putative type II secretion protein GspC  26.8 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0726  general secretion pathway protein C  27.87 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0002  general secretion pathway protein C  23.69 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.856958  normal  0.237385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  32.19 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2028  general secretion pathway protein C  28.81 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0249  hypothetical protein  25.91 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00883556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  28.12 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  23.33 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1348  hypothetical protein  29.21 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.671423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.6 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  24.14 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03126  hypothetical protein  24.53 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.013931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03175  general secretory pathway component, cryptic  24.53 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0389  general secretion pathway protein C  24.53 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.125631  normal  0.017456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0389  general secretion pathway protein C  24.53 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000776949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3518  general secretion pathway protein C  24.53 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000156607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  25.21 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  23.97 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  27.12 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  29.87 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  31.17 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23980  secretion protein XcpP  29.33 
 
 		 235 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  26.04 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2029  secretion protein XcpP  29.53 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2590  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.74 
 
 		 273 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  34.23 
 
 		 497 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  27.27 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  25.97 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4252  hypothetical protein  36 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1955  putative general secretion pathway protein  23.32 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00138161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  37.5 
 
 		 449 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  40.74 
 
 		 498 aa  42.4  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.85 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>