32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3363 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  100 
 
 		 290 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  65.64 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  57.97 
 
 		 292 aa  322  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  60.57 
 
 		 296 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  58.84 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  54.74 
 
 		 288 aa  272  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  31.15 
 
 		 327 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  31.15 
 
 		 327 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  31.15 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  32.74 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  30.63 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.3 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.48 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  32.5 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.07 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  27.57 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  24.69 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.47 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  25.31 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  23.99 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  31.17 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  34.72 
 
 		 537 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3020  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.35 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  29.87 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.11 
 
 		 523 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  29.47 
 
 		 492 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  31.94 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  29.47 
 
 		 492 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  36.49 
 
 		 517 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0536  hypothetical protein  26.13 
 
 		 535 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.4287  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  32.86 
 
 		 450 aa  42.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0314  type II secretion system protein C  27.39 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>