27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0597 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  95.95 
 
 		 296 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  69.46 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  58.33 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  58.52 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  55.22 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  26.85 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  32.31 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  32.31 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  34.91 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.02 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.71 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  27.42 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  25.12 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.14 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  23.39 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  30.08 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  27.27 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  24.55 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  27.27 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  26.23 
 
 		 411 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  29.35 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  32.22 
 
 		 476 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  31.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  29.87 
 
 		 393 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>