28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0330 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  100 
 
 		 291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  65.64 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  59.8 
 
 		 292 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  59.38 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  57.89 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  48.84 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  33.08 
 
 		 327 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  33.08 
 
 		 327 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  33.6 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  33.04 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  21.62 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.92 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  25.52 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  26.12 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  25.26 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  22.34 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  24.62 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  25.61 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  24.26 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.26 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  24.72 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.76 
 
 		 323 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  28.42 
 
 		 492 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  28.42 
 
 		 492 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  28.3 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  33.87 
 
 		 535 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>