32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0684 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  100 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  69.9 
 
 		 296 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  68.01 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  59.32 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  63.79 
 
 		 290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  55.07 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.29 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  33.87 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  33.03 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  36.11 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.42 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  27.05 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  26.67 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  23.15 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  23.97 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  29.41 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  24.44 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  23.02 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  23.43 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  23.02 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  23.02 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  23.02 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  23.57 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  23.37 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  29.79 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  25.54 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  29.87 
 
 		 393 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  34.38 
 
 		 450 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  23.96 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  36.07 
 
 		 451 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>