45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2607 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  100 
 
 		 317 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  34.55 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  46.85 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  46.85 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  45.95 
 
 		 342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  26.85 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  36.11 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  26.7 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  25.29 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  33.04 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  32.74 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.36 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0120  type II secretion system protein C  24.92 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000735781  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.52 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  24.61 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  24.73 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  26.32 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0168  general secretion pathway protein C  25.68 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0176873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  26.32 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  24.11 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0152  general secretion pathway protein C  22.36 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30752  normal  0.16929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0152  general secretion pathway protein C  22.36 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.641233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0148  general secretion pathway protein C  22.36 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4207  general secretion pathway protein C  22.36 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000718713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  25.18 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  26.42 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  25.33 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0150  general secretion pathway protein C  23.08 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00215157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  25 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0155  general secretion pathway protein C  23.08 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0113591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0150  general secretion pathway protein C  23.08 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.752354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0165  general secretion pathway protein C  24.18 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  23.85 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  26.37 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  23.25 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  24.79 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3568  general secretion pathway protein C  22.83 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00690915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  25.22 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2307  general secretion pathway protein C  23.46 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  25.77 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  25.74 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0488  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.16 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2376  general secretion pathway protein C  26.37 
 
 		 359 aa  46.2  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.490477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  39.34 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>