36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1040 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  23.29 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  29.2 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  29.2 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  29.2 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  24.18 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  26.78 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  22.89 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  35.87 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  23.77 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  25.49 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  21.33 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  23.14 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  26.8 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  25.52 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  25.86 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  30.09 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0104  general secretion pathway protein C  23.49 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001893  general secretion pathway protein C  22.89 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  27.16 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  25.6 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4735  general secretion pathway protein C  23.01 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000515077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  27.31 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0096  general secretion pathway protein C  23.38 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.140441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3620  general secretion pathway protein C  24.07 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00688552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0143  general secretion pathway protein C  23.18 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0488  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.52 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1469  general secretion pathway protein C  25.51 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.954989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4359  general secretion pathway protein C  23.15 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  17.3 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2654  type II secretion system protein C  24.29 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0380  hypothetical protein  23.2 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.491044  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  39.13 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0140  general secretion pathway protein C  27.36 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  25.1 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  32.95 
 
 		 476 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>